Για την έναρξη εκπόνησης Διπλωματικής Εργασίας, ο/η φοιτητής/τρια οφείλει να έχει εξεταστεί επιτυχώς σε μαθήματα που αντιστοιχούν συνολικά σε τουλάχιστον 210 πιστωτικές μονάδες (ECTS).
Ο αριθμός των προσφερόμενων Διπλωματικών Εργασιών (ΔΕ) και τα θέματά τους καθορίζονται στην αρχή του 9ου εξαμήνου, με ευθύνη των Τομέων. Οι φοιτητές/ήτριες καλούνται να δηλώσουν το ενδιαφέρον τους για εκπόνηση ΔΕ σε έως δύο (2) από τα προσφερόμενα θέματα, με σειρά προτεραιότητας. Η δήλωση υποβάλλεται στη Γραμματεία του Τμήματος μέχρι το τέλος Οκτωβρίου. Κατά κύριο λόγο, οι φοιτητές/ήτριες οφείλουν να επιλέγουν θέματα ΔΕ που προσφέρονται από τον Τομέα που έχουν επιλέξει. Είναι δυνατή η εκπόνηση ΔΕ σε άλλο Τομέα, εφόσον οι βαθμολογίες του/της φοιτητή/ήτριας στα μαθήματα του εν λόγω Τομέα εγγυώνται την επιτυχή ολοκλήρωσή της.
Η ανάθεση των ΔΕ γίνεται από επιτροπή του κάθε Τομέα, το αργότερο μέχρι τα μέσα του Νοεμβρίου. Για την επιλογή φοιτητών/τριών, λαμβάνονται υπόψη οι βαθμολογίες των υποψηφίων στα συναφή μαθήματα, οι ειδικότερες ικανότητές τους σε σχέση με τις απαιτήσεις του θέματος της ΔΕ, οι προοπτικές για περαιτέρω ερευνητική δραστηριότητα, κλπ.
Για κάθε ΔΕ καθορίζεται ένα μέλος ΔΕΠ του Τμήματος ως επιβλέπων καθηγητής/τρια. Διδάσκοντες/ουσες του Τμήματος που έχουν προσληφθεί σύμφωνα με το ΠΔ 407/80 ή τους έχει ανατεθεί αυτοδύναμη διδασκαλία μαθήματος, μπορούν να ορίζονται ως συνεπιβλέποντες/ουσες. Η δυνατότητα ορισμού συνεπιβλέποντος/ουσες ισχύει μόνο κατά την περίοδο ανάθεσης διδασκαλίας και μπορεί να ολοκληρωθεί και πέραν αυτής.
Ο σχεδιασμός της ΔΕ κάθε φοιτητή/ήτριας γίνεται με ευθύνη του/της επιβλέποντος/επιβλέπουσας καθηγητή/ήτριας. Ο τρόπος συγγραφής της ΔΕ ακολουθεί τους κανόνες που περιγράφονται στις οδηγίες εκπόνησης διπλωματικής εργασίας και στον Οδηγό - Υπόδειγμα Συγγραφής Διπλωματικής Εργασίας.
Μετά το πέρας της συγγραφής της ΔΕ, και μετά τη σύμφωνη γνώμη του/της επιβλέποντα/ουσας περί της ολοκλήρωσής της, ορίζονται δύο ακόμη μέλη, τα οποία μαζί με τον/την επιβλέποντα/ουσα θα αποτελέσουν την Τριμελή Εξεταστική Επιτροπή. Δικαίωμα συμμετοχής στις τριμελείς εξεταστικές επιτροπές των ΔΕ έχουν τα μέλη ΔΕΠ, επιστημονικοί συνεργάτες, διδάσκοντες σύμφωνα με το ΠΔ 407/80, πανεπιστημιακοί υπότροφοι και ΕΔΙΠ του Τμήματος, καθώς και ερευνητές ινστιτούτων ή μέλη ΔΕΠ άλλων Τμημάτων του ΠΘ και άλλων ΑΕΙ.
Στα μέλη της Τριμελούς Επιτροπής παραδίδεται από ένα αντίτυπo της ΔΕ. Όταν η Επιτροπή κρίνει ότι η εργασία είναι πλήρης, υποστηρίζεται δημόσια, μετά από ανακοίνωση της Γραμματείας του Τμήματος, σε συγκεκριμένη ημερομηνία. Η γλώσσα συγγραφής της ΔΕ είναι καταρχάς η ελληνική, αλλά κατόπιν έγκρισης από τη Συνέλευση Τμήματος, η γλώσσα συγγραφής μπορεί να είναι και η αγγλική. Η τελική αξιολόγηση και κρίση της ΔΕ γίνεται από την Τριμελή Επιτροπή. Η ΔΕ βαθμολογείται με βαθμό από 0-10 με ελάχιστο βαθμό επιτυχίας το 5.
Η εγκεκριμένη ΔΕ, μετά τις τυχόν διορθώσεις που προτείνει η Επιτροπή, κατατίθεται ένα (1) βιβλιοδετημένο έντυπο και ένα (1) σε ηλεκτρονική μορφή στην Κεντρική Βιβλιοθήκη του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας με ευθύνη του/της φοιτητή/ήτριας.
Φοιτητής/ήτρια που επιθυμεί να αλλάξει το θέμα και τον/την επιβλέποντα/ουσα καθηγητή/ήτρια της ΔΕ που του/της έχει ανατεθεί, πρέπει να εξασφαλίσει την έγκριση του/της αρχικού/ής επιβλέποντα/ουσας. Σε αντίθετη περίπτωση το θέμα παραπέμπεται στη Συνέλευση Τμήματος.