Η έρευνα και οι διδακτικές ανάγκες του Τμήματος υποστηρίζονται από τα ακόλουθα εργαστήρια:
• Εφαρμογών Πληροφορικής στην Επιστήμη του Πολιτικού Μηχανικού
Τομέας Γεωτεχνικής και Περιβαλλοντικής Μηχανικής
• Υπολογιστικής Γεωτεχνικής Μηχανικής
Τομέας Δομοστατικής
• Ανάλυσης και Σχεδιασμού Κατασκευών
• Tεχνολογίας και Kατασκευών Οπλισμένου Σκυροδέματος
• Αντοχής Υλικών και Μικρομηχανικής
Τομέας Μεταφορών, Συγκοινωνιακών Υποδομών και Περιβαλλοντικής Διαχείρισης
• Oδοποιίας
• Περιβαλλοντικής Ακουστικής Συγκοινωνιακών Έργων (Ε.Π.Α.Σ.Ε.)
• Κυκλοφορίας, Μεταφορών και Διαχείρισης Εφοδιαστικής Αλυσίδας - TTLog
Τομέας Υδραυλικής και Περιβαλλοντικής Μηχανικής
• Yδρομηχανικής και Περιβαλλοντικής Tεχνικής
• Υδρολογίας και Ανάλυσης Υδατικών Συστημάτων